注册商标时不能选择低价的主要原因如下：

商标注册成功率低：低价商标注册服务往往采用标准化模板，缺乏针对性和细致的审核。商标注册申请人可能会因此忽略重要细节，导致商标注册申请被驳回或被他人提出异议，从而商标注册不成功。

商标专用权受限：低价服务通常只包括商标注册的基本服务，而不包括专业的商标咨询服务。这可能使商标注册申请人无法获得多方面的商标保护，从而使商标专用权受到限制。

隐藏费用和服务质量：低价注册商标服务可能先以低价吸引客户，然后通过附加各种名目的费用来获取更多利润，实际费用可能比正常价格更高。同时，服务质量可能也会因价格过低而受到影响。

虚假宣传和夸大承诺：部分低价代理机构可能承诺无法实现的服务，如保证100%的注册成功率或快速获取证书等，这些虚假宣传和夸大承诺可能会对申请人造成误导和损失。

综上所述，在选择商标注册代理机构时，申请人不仅应考虑价格因素，更应关注代理机构的专业能力、服务质量和信誉度等方面，以确保自己的权益得到保障。同时，建议申请人在选择代理机构前进行充分的调查和了解，避免被低价服务所吸引而忽视了商标注册的重要性和复杂性。